L’ICCC sorgeix amb la voluntat per part del govern de la Generalitat, el 28 de setembre de 1999, d’endegar un gran projecte i de donar un nou impuls a les activitats de recerca, de desenvolupament i d’innovació, activitats clau per a la competitivitat de Catalunya.

El govern de la Generalitat va aprovar la constitució del Consorci Institut Català de Ciències Cardiovasculars i dels seus estatuts en sessió de govern del dia 24 de juliol de 2000, i es va publicar per resolució de 25 de juliol de 2000 al DOGC núm. 3201 de 9 d’agost de 2000.

Als països desenvolupats, les malalties cardiovasculars són la primera causa de mortalitat. Així mateix, es van presentant també com a primera causa de mort en els països en vies de desenvolupament. Per això, els estudis relacionats amb el sistema cardiovascular i les seves disfuncions són un dels camps de la recerca biomèdica que més ha crescut els darrers anys arreu del món. Gràcies a la incorporació de noves tecnologies que faciliten l’abordatge d’estratègies de regulació gènica i molecular, es troba, a més a més, en un moment de gran potencialitat innovadora.